Das Jahr 2009 war für die Güterschifffahrt auf der Donau äußerst schwierig. Einerseits wirkte sich die Weltwirtschaftskrise auch stark auf die Binnenschifffahrt in Österreich aus, andererseits sah sich der Sektor mit witterungsbedingten Sperren der Wasserstraße konfrontiert. Die in diesem Jahr transportierte Gütermenge spiegelt diese ungünstigen Rahmenbedingungen wider: so wurden rund 9,3 Mio. Tonnen Güter auf der österreichischen Donau befördert, was einen Rückgang von 16,8 % oder 1,9 Mio. Tonnen gegenüber dem Jahr 2008 bedeutet. Entsprechend reduzierte sich auch die Transportleistung innerhalb des Bundesgebietes um 15,1 % auf 2,0 Mrd. Tonnenkilometer.

Mit Herbst 2008 begann die industrielle Produktion in Europa deutlich zu sinken, was sich auch negativ auf die Nachfrage nach Transporten mit dem Binnenschiff auswirkte. Eine leichte konjunkturelle Erholung setzte in den Ländern Europas ab der zweiten Jahreshälfte 2009 ein. Hinsichtlich der auf der österreichischen Donau transportierten Gütermenge wurde die Talsohle im Güterverkehr im zweiten Quartal erreicht. Ab dem zweiten Halbjahr 2009 war ein Aufwärtstrend zu beobachten.

Im Import, der einen Anteil von 53,1 % am Gesamtgüterverkehr per Binnenschiff hatte, verringerte sich das Transportaufkommen gegenüber 2008 um 13,7 % oder 785.329 Tonnen auf 4,9 Mio. Tonnen, wobei knapp 75 % der Güter von Osten kommend das Bundesgebiet erreichten.

Für den Export war im Vergleich zum Rekordwert des Vorjahres (+40 % gegenüber 2007) ein Rückgang von 27,0 % oder 584.967 Tonnen auf 1,6 Mio. Tonnen zu verzeichnen. Analog zum Jahr 2008 passierten in diesem Verkehrsbereich 52 % der Güter die Ostgrenze und 48 % die Westgrenze des Bundesgebietes.

Das Transportaufkommen im Transit verringerte sich um 12,2 % oder 343.840 Tonnen auf 2,5 Mio. Tonnen. Hierbei handelt es sich um einen hochgerechneten Wert, da eine bestehende Untererfassung des Transitverkehrs von der Statistik Austria mittels Schätzmodell ausgeglichen wird.

Der Inlandverkehr auf der Wasserstraße Donau ging schließlich um 34,4 % oder 172.766 Tonnen auf 329.462 Tonnen zurück.